Références
Auteurs : Selinsky, B.S., Gupta, K., Sharkey, C.T., Loll, P.J.
Source : PDB Identifiant : 1eqg
Modification :Seule la chaîne A du modèle initial a été conservée. Les molécules d'eau et la plupart des hétéroatomes (NAG,...) ont été supprimés.
Classification
Organisme d'origine : Mouton
Catégorie :
Description
Les cyclo-oxygénases sont des enzymes qui catalysent la première étape d'une cascade de signaux intracellulaires (enzyme COX-1) ou extracellulaires (enzyme COX-2), impliqués entre autres, dans les mécanismes inflammatoires. Au cours de cette première étape, l'acide arachidonique est converti en PGH2 (ProstaGlandine H2).
La réaction est catalysée par la Tyrosine en position 385 dans le site actif avec intervention d'un groupement porphyrique de type hème. L'acide arachidonique s'introduit dans ce site actif par un canal.
Ce modèle présente l'action de l'ibuprofène (référencé IBP) sur la COX-1. Il met en évidence la localisation de l'ibuprofène à l'entrée du site actif. Le groupe carboxyle de l'ibuprofène est en contact avec la chaîne latérale de l'arginine 120, de charge électrique opposée (liaison ionique réversible). L'ibuprofène agit donc comme un inhibiteur compétitif sur la COX-1.
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